Cả đội U22 Việt Nam lẫn đội tuyển nữ Việt Nam đều được xếp vào nhóm hạt giống số 1 tại môn bóng đá SEA Games 33.
Vào sáng ngày 21/5/2025, Ban tổ chức Liên đoàn Bóng đá Đông Nam Á (AFF) đã tiến hành cuộc họp tại Bangkok, Thái Lan nhằm thảo luận và phê duyệt kế hoạch tổ chức các giải bóng đá trong năm 2025 cũng như những sự kiện quan trọng trong năm 2026, đặc biệt là bóng đá nam và nữ tại SEA Games 33. Ông Trần Quốc Tuấn, Chủ tịch Liên đoàn Bóng đá Việt Nam, đã chủ trì cuộc họp trong vai trò Trưởng Ban thi đấu AFF.
Theo thông báo, môn bóng đá nam tại SEA Games 33 sẽ có sự góp mặt của 11 đội, được chia thành 3 bảng: bảng A có 3 đội, trong khi bảng B và C mỗi bảng có 4 đội. Các đội bóng được chia thành các nhóm hạt giống dựa trên thành tích và quyền đăng cai. Nhóm 1 bao gồm Thái Lan (đội chủ nhà, mã A1), Indonesia và Việt Nam; nhóm 2 có Myanmar, Malaysia, Campuchia; nhóm 3 có Timor Leste, Philippines, Lào; nhóm 4 gồm Singapore và Brunei. Các đội sẽ thi đấu theo thể thức vòng tròn một lượt, với ba đội đứng đầu bảng cộng đội nhì có thành tích tốt nhất sẽ vào bán kết.

Vòng bảng sẽ diễn ra từ ngày 3/12 đến 12/12; bán kết vào ngày 15/12; trận tranh hạng Ba và chung kết được tổ chức vào ngày 18/12. Các thành viên của Ban tổ chức đã đồng ý đề xuất với Ban tổ chức SEA Games rằng các trận đấu cuối vòng bảng nên diễn ra cùng thời điểm để bảo đảm tính công bằng và chuyên môn.
Ba sân vận động được chọn làm địa điểm thi đấu sẽ là Rajamangala (Bangkok), Tinsulanonda (Songkhla) và 700th Anniversary of Chiangmai (Chiangmai). Sân Rajamangala cũng sẽ là nơi chính tổ chức các trận bán kết, tranh hạng Ba và chung kết.

Đối với môn bóng đá nữ, có 9 đội tuyển tham gia được chia thành 3 bảng, mỗi bảng có 3 đội. Nhóm hạt giống số 1 gồm Thái Lan (đội chủ nhà, mã A1), Việt Nam và Myanmar; nhóm 2 là Campuchia, Philippines, Singapore; nhóm 3 bao gồm Malaysia, Lào, Indonesia.
Thể thức thi đấu của môn bóng đá nữ sẽ tương tự như của môn bóng đá nam, với các trận vòng bảng diễn ra từ ngày 4/12 đến 13/12; bán kết vào ngày 14/12; trận tranh hạng Ba và chung kết diễn ra vào ngày 17/12. Hai sân được lựa chọn cho các trận đấu vòng bảng của môn bóng đá nữ sẽ là Chonburi và TNSU Chonburi.